Swissnoso widmet sich der Reduktion von Infektionen, die durch den Aufenthalt oder die Behandlung in einem Krankenhaus oder einer Pflegeeinrichtung verursacht werden. Weiter hat sich Swissnoso auch der Eindämmung von Antibiotikaresistenz verschrieben.

Swissnoso veröffentlicht regelmässig Analysen und Empfehlungen.

Im Austausch mit Bund und Kantonen arbeitet Swissnoso seit Jahren an der Entwicklung und Umsetzung des Nationalen Programms Swiss Clean Care zur wirkungsvollen Reduktion von Spitalinfektionen in der Schweiz. Im Auftrag des Nationalen Vereins für Qualitätsentwicklung in Spitälern und Kliniken (ANQ) führt Swissnoso die landesweite Erfassung von postoperativen Wundinfektionen durch. Diese ist Teil des ANQ-Messplans und für Swissnoso gleichzeitig ein Modul von Swiss Clean Care. Als weitere Module von Swiss Clean Care bietet Swissnoso ein Interventionsmodul zur Prävention postoperativer Wundinfektionen, Module zur Überwachung und Prävention von Katheter-assoziierten Harnwegsinfektionen und ein Modul zur Verbesserung der Händehygiene-Compliance an. Zudem führt Swissnoso regelmässig nationale Punktprävalenz-Erhebungen von Healthcare-assoziierten Infektionen und des Einsatzes von Antibiotika in Schweizer Akutspitälern durch.

In direkter Zusammenarbeit mit dem Bundesamt für Gesundheit (BAG) trägt Swissnoso zum Management von akuten epidemiologischen Herausforderungen bei wie Creutzfeldt-Jakob-Krankheit, SARS, virale hämorrhagische Fieber, Anthrax und Grippe.

Zusätzlich engagiert sich Swissnoso in der Ausbildung von Hygienepersonal.